Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM8A1Q9UBU6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms