Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCH4Q9P2E8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCH4Q9P2E8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms