Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms