Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM6Q9NX76 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms