Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms