Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms