Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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