Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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COL25A1Q9BXS0 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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COL25A1Q9BXS0 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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COL25A1Q9BXS0 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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COL25A1Q9BXS0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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COL25A1Q9BXS0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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COL25A1Q9BXS0 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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COL25A1Q9BXS0 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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COL25A1Q9BXS0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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