Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS4Q96RK4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms