Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms