Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms