Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC58Q96CX6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms