Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3KBP1Q96B97 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3KBP1Q96B97 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3KBP1Q96B97 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3KBP1Q96B97 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3KBP1Q96B97 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3KBP1Q96B97 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3KBP1Q96B97 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms