Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF3Q92576 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms