Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAB3Q8WWW8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms