Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms