Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C10orf53Q8N6V4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C10orf53Q8N6V4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms