Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNE4Q8N205 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms