Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APTXQ7Z2E3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms