Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms