Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KLHL12Q53G59 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms