Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FHOD3Q2V2M9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms