Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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GEN1Q17RS7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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GEN1Q17RS7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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