Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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