Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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