Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR1D2Q14995 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms