Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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