Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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