Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP1A4Q13733 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms