Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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