Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM28Q13263 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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