Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PTGDRQ13258 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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