Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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