Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COX10Q12887 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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COX10Q12887 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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COX10Q12887 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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COX10Q12887 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COX10Q12887 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COX10Q12887 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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