Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SMARCB1Q12824 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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