Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms