Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms