Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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