Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB8AP61006 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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