Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLTCL1P53675 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLTCL1P53675 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms