Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPAP53621 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPAP53621 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COPAP53621 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms