Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR5P51681 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR5P51681 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR5P51681 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms