Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms