Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A3P48751 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms