Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PCP4P48539 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SPATA31C1-202ENST00000602681 1927 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PCP4P48539 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 RNPC3-202ENST00000524631 2013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ARL3-201ENST00000260746 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 TTC8-205ENST00000358622 2297 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 AC079465.1-201ENST00000416046 3361 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 GRHL3-203ENST00000356046 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ACVR1-203ENST00000410057 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PCP4P48539 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 PHACTR3-205ENST00000395636 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 MCPH1-207ENST00000522905 2049 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 PAK1-202ENST00000356341 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PCP4P48539 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms