Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms