Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMBRP28336 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMBRP28336 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMBRP28336 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMBRP28336 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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