Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PLNP26678 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PLNP26678 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms