Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPREP23469 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTPREP23469 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPREP23469 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPREP23469 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPREP23469 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPREP23469 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPREP23469 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPREP23469 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPREP23469 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPREP23469 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPREP23469 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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