Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTPS1P17812 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTPS1P17812 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTPS1P17812 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTPS1P17812 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms